La evaluación de programas preventivos va a ser un proceso central y con continuidad dentro de este proyecto de promoción de intervenciones preventivas basadas en la evidencia. Básicamente se evaluarán programas preventivos españoles que tengan algún tipo de relevancia, pero también se incluirán ocasionalmente programas extranjeros conocidos o que merezcan algún interés especial. Es importante tomar en consideración que este sistema de categorización de los programas tiene sobre todo en cuenta las evaluaciones a que han sido sometidos dichos programas. Las características propias del programa pasan así a tener sólo una importancia relativa, si no se ha realizado una evaluación del mismo.

En el caso español la selección de programas a ser evaluados está muy avanzada y sus evaluaciones se van incluyendo a medida que se van realizando. La responsabilidad de la evaluación es del comité científico, pero también pueden participar miembros del Grupo de expertos. Esta evaluación se hace con la colaboración de los autores o responsables de los programas siempre que ello sea posible, siguiendo los Criterios de selección de programas establecidos, que siguen estrictamente la metodología científica y que son similares a los otros proyectos similares.